Layoutフォルダをカスタマイズしちゃったら該当箇所のサポートが受けにくくなりそうなのでお勧めしないのですがKBがありました。
サポートしてもらえない可能性があっても、要望が多いのでしょうね。
せめて、これは守ってねという指針だと思います。
カスタマイズ方法として2通り記載されています。
機械翻訳？なのか変な感じです。
概略は下記の通り。
- SharePoint HiveのLayoutsフォルダのバックアップを取ってカスタマイズしましょう
- カスタマイズするサイトコレクション用に、SharePoint HiveのLayoutsフォルダをコピーして、サイトコレクションの「/_layouts」をコピーしたLayoutsフォルダでIISの「仮想ディレクトリ」に設定する。
文書を見る限り２がお勧めな感じです。
サイトコレクション単位に設定される＋SP適用に上書きされない（手動でファイルをコピーする必要はあると思うが、、）
